已取得助理医师执业证书和乡村医生证书，在家行医一般不视为非法。依据《乡村医生从业管理条例》，取得相应证书在村医疗卫生机构从事医疗服务，不构成非法行医。但若未按规定注册或超出服务范围，可能面临行政处罚，甚至构成犯罪。
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已取得证书在家行医，应确保按规定注册并遵守服务范围。处理方式包括：向当地卫生行政部门咨询注册流程，确保合法行医；若遇争议，可寻求法律援助或咨询专业律师。选择处理方式时，需根据具体情况判断，确保合法合规。
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已取得证书可合法行医。操作：1.向卫生行政部门申请注册，确保行医合法；2.遵守《乡村医生从业管理条例》，在规定范围内行医；3.如遇法律问题，及时咨询律师，维护合法权益。注意，行医需谨慎，确保安全有效。